稽查執(zhí)法系統(tǒng)包括案源管理系統(tǒng)、案件辦理系統(tǒng)、行政處罰簡易程序、行政案件管理、行政強制措施、行刑銜接。

1、案源管理系統(tǒng)

通過覆蓋案件線索的來源、登記、處置結(jié)果、流轉(zhuǎn)過程等環(huán)節(jié)，明確實效及責任人員，對在日常監(jiān)管、投訴舉報、產(chǎn)品抽檢等渠道獲得的違法信息和案件線索進行統(tǒng)一管理，從而實現(xiàn)案源線索管理的信息化、程序化、科學化。

2、案件辦理系統(tǒng)

實現(xiàn)食品藥品行政處罰案件全過程網(wǎng)上運行，分解案件立案審批、調(diào)查、終結(jié)報告、合議、重大案件集體討論、事先告知、處罰決定、執(zhí)行等各環(huán)節(jié)，明確不同環(huán)節(jié)的人員和崗位，確定相應權限，使該系統(tǒng)實現(xiàn)案件查處、文書制作、電子審批等多項功能。

3、行政處罰簡易程序

適用于對違法事實確鑿，并有法定依據(jù)，對公民處以五十元以下，對法人或其他組織處以一千元以下罰款或者警告，并當場作出行政處罰的案件。在日常檢查時根據(jù)檢查結(jié)果選擇現(xiàn)場處罰進入簡易程序執(zhí)法流程。

4、行政案件管理

與案件辦理系統(tǒng)相關聯(lián)，包括協(xié)查協(xié)辦和督查督辦兩個功能，主要是通過案件查辦過程中相關文件的流轉(zhuǎn)，起到異地調(diào)查取證或者案件督查督辦的作用。

協(xié)查協(xié)辦是執(zhí)行國家局行政案件協(xié)助調(diào)查取證制度的具體體現(xiàn)，從程序上明晰了該項工作所需流轉(zhuǎn)環(huán)節(jié)、調(diào)查時間、調(diào)查人員等，實現(xiàn)對協(xié)查協(xié)辦的規(guī)范化管理。

督查督是上級局大要案督查督辦制度的具體體現(xiàn)。主要是需要市局督查督辦的本市轄區(qū)內(nèi)重大行政處罰案件。分市局主動督查督辦和轄市區(qū)局提請督查督辦兩種情況。

5、行政強制措施

辦案機關在查處違法行為過程中，在證據(jù)可能滅失或者以后難以取得的情況下，可以采取先行登記保存措施；法律、行政法規(guī)規(guī)定扣留、封存等行政強制措施的，可以根據(jù)具體情況實施。功能包括先行登記保存管理、物品查封管理、物品扣押管理。

6、行刑銜接

行刑銜接系統(tǒng)不僅有利于充分發(fā)揮行政執(zhí)法和刑事司法的優(yōu)勢互補、資源共享，整合執(zhí)法資源，及時、準確、有效地打擊犯罪，也有利于監(jiān)督、糾正行政執(zhí)法機關的不作為、亂作為現(xiàn)象，促使其依法行政、嚴格執(zhí)法，促進法治政府建設。